广州都市报

您现在的位置: 细胞 > 细胞简介 > 测序组学助力新的酶发现

测序组学助力新的酶发现

发布时间:2024/5/16 16:06:31   点击数:
看白癜风到中科白癜风医院 http://www.yushiels.com/m/

年,深度学习算法AlphaFold2在从原始序列预测蛋白质三维结构方面取得了里程碑式的成果。

宏基因组学产生的大量测序数据,让人们得已窥见未经培养的微生物的生物合成潜力。与初级代谢途径相比,参与次级代谢的酶往往催化不同底物的特殊反应,这些途径为发现新的酶学提供了丰富的资源。

到目前为止,从环境DNA(eDNA)研究中发现新的酶或功能大多数是通过PCR筛选或基于活性位点的筛选方法获得的。作为另一种选择,鸟枪法宏基因组学也具有从eDNA中直接发现新酶的能力,还可以避免由于PCR或活性导向的功能宏基因组学工作流程引入的共同偏差。

最近发表的一篇长综述,作者引经据典,紧跟形势,为宏基因组学在酶学领域构建了一张宏伟蓝图。文章中比较了发现酶的方法,包括系统发育学、序列相似性网络、机器学习技术等。也讨论了各种实验策略来测试计算预测,包括异源表达和筛选。

除了这些广泛使用的方法,还补充了一些新兴技术如宏组学、单细胞基因组学、无细胞表达系统等方法及建议。这里,我们沿着作者给出的路线,为大家做个导读。

首先作者在文章中明确指出两点,文章中主要

转载请注明:http://www.youlizhouyi.com/xbji/13324.html

网站简介 | 发布优势 | 服务条款 | 隐私保护 | 广告合作 | 合作伙伴 | 版权申明 | 网站地图

当前时间: