摘要目的晚期上皮性卵巢癌不满意的肿瘤细胞减灭术会导致不良预后，这种不良的结局是不可切除肿瘤的固有生物学特征？还是不满意的外科手术导致肿瘤克隆的残存所致？本研究的目的是探讨不满意手术切除的肿瘤分子途径和细胞类型。方法通过比较满意和不满意肿瘤细胞减灭术患者的基因表达，确定和不满意肿瘤细胞减灭术相关的基因网络，探索与该基因网络相关的生物学过程和细胞类型。结果不满意肿瘤细胞减灭术患者表现为独特的分子亚型，特点是活化间质细胞和淋巴脉管浸润，类似的分子途径也出现在卵巢癌转移瘤中，这表明不满意肿瘤细胞减灭术原发肿瘤的生物学行为类似转移瘤，同时其基因网络中富含反应性肿瘤间质细胞，而不是恶性肿瘤细胞。结论肿瘤细胞减灭术是否成功取决于肿瘤自身的生物学特性，如广泛的间质反应和侵袭性增加，这可能会影响手术切除，并最终导致较低的生存率。
1.前言
上皮性卵巢癌（EOC）多属晚期，存在广泛腹腔内扩散，标准治疗为肿瘤细胞减灭术，并辅助铂类和紫杉醇化疗。研究表明癌灶残留与预后相关[1,2]。如果患者存在要害器官转移病灶很难达到R0，最好选择放弃PDS，行新辅助化疗来降低肿瘤负荷，通过IDS达到完全切除的目的。但目前尚没有合适的生物学标志预测不满意的肿瘤细胞减灭术[1,2]，已经开展的几项评估手段，包括CT、血清CA以及腹腔镜探查，但并没有足够的特异度和/或灵敏度达到临床决策要求[3-9]。
导致不满意肿瘤细胞减灭术患者不良结局的原因不得而知，目前存在两种理论：1.残存的肿瘤细胞数量决定肿瘤生长速度以及化疗的有效性。具体而言，肿瘤细胞减灭术可减少肿瘤负荷或抵抗克隆，延迟化疗耐药，切除大量坏死组织可能会增加药物输送到小的、乏氧的肿瘤组织，残存的微小病灶大多为增殖细胞，有较高的化疗敏感性，切除特殊部位的肿瘤（比如容易造成肠梗阻的肿瘤）能改善患者的整体状况和免疫功能等。2.肿瘤内在的侵袭性特征可造成手术失败、化疗抵抗、快速增长及侵袭性强等。如果不可切除肿瘤的生物学行为与可切除肿瘤不同，那么它们就可能具有不同的分子特征。最近两项研究用表达谱数据来区分不满意肿瘤细胞减灭术肿瘤的分子特征[11,12]，虽然利用不同的数据和参数，但是合成的基因特征大部分是重叠的，呈现出相同的生物学过程，如细胞外基质重塑、侵袭和血管再生等[11,12]，而这些过程和EOC的进展与转移相关，表明肿瘤细胞减灭术的成功与否取决于肿瘤的生物学特征。本研究旨在分析不满意肿瘤细胞减灭术的分子途径，来确定可能决定手术结局和疗效的潜在生物学过程。
2.材料和方法
2.1.数据库和患者入组标准卵巢癌基因表达的三大数据库为TCGA，GSE[13]，和GSE[14]，肿瘤细胞减灭术的信息可以从卵巢数据库R下载[15]。数据库中的所有数据经过预处理，在基因水平上进行标准化。本研究限制在原发、晚期卵巢浆液性癌，低级别EOC、非浆液性EOC、转移性肿瘤或其他疾病均被排除。这三大数据库分别有，，例患者，其中有，93，66例为不满意肿瘤细胞减灭术患者，TCGA和GSE数据库被用来确定分子标记，而GSE数据库用于验证这些分子标记和评估预测能力。
2.2.统计分析策略候选基因是根据差异表达基因和差异基因网络来确定。首先，两个数据库（TCGA和GSE）标准化表达谱是从不满意和满意肿瘤细胞减灭术患者的差异表达基因中筛选的，每个数据库分别采用双样本t检验，P≤0.05有统计学意义。两个数据库中获得共同的差异表达基因被合并在一起，用于建立共同和差异基因网[16,17]，从差异基因网中筛选出候选基因标记，并通过不相关的数据库进行验证（GSE）。
2.3.多变量模型和验证指标应用不相关的数据库GSE分别验证这些候选基因，多变量逻辑回归和双侧t-tst用于确定基因在验证数据集表达式的值。ROC和AUC被用来评估所确定基因标记的预测能力。MATLAB统计工具被用来进行多变量逻辑回归模型和AUC评估。
2.5.公共表达谱数据集分析R2基因组学分析和可视化平台(全国治白癜风最好医院北京白癜风医学研究院
