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震惊Cell杂志惊现化学类文章

发布时间:2017-9-27 20:02:44   点击数:

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提起三大神刊CNS(Cell、Nature、Science),每个搞科研(或被科研搞)的人应该都有所耳闻。Nature和Science刊发的是各个学科最前沿的研究成果,出现化学领域的大作十分常见。Cell,顾名思义是“细胞”,似乎和化学分属两个不同的一级学科。可是,最近Cell杂志刊发了一篇和化学密切相关的研究论文,着实让人震惊(标题用了“震惊!”体,诸君勿怪~~)。这么有意义的事件,本君自然不会放过,今天就为大家简要梳理一下这篇文章。

看论文标题中的关键字“NovelLead”,诸君大概猜到了,这篇发在Cell上的文章居然来自药物化学领域。那么这个“新型先导化合物”是从何而来?文章又是哪里出彩才得到眼高于顶的Cell编辑部的青睐?

咱们拧掉文章里的水份直接上干货。化合物TAM1是美国德克萨斯AM大学JamesC.Sacchettini教授团队前期发现的抗结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis)的活性化合物,并且证明了聚酮合酶13(PolyketideSynthase13,PKs13)是该化合物的直接作用靶点。作者发现TAM1耐药的突变株中,PKs13的硫酯酶(TE)结构域中都能找到突变氨基酸。因此,作者明确了要研究TAM1对PKs13TE结构域的作用。

JamesC.Sacchettini教授。图片来源:TexasAMUniversity

好啦,破题以后就可以开始走套路了。

提问:研究小分子与蛋白质相互作用的技术都有哪些啊?

回答:有X-Ray、NMR、SPR、ITC、MS、生化反应……(点击阅读详细)。

作者先选用生化反应来评价TAM1对PKs13-TE具有抑制作用,并且明确作用强度(IC50=0.26μM);然后直接祭出大杀器X-Ray共晶结构,详细解析了TAM1与PKs13-TE的精确作用形式。咱还是直接上图吧。

新型苯并呋喃化合物抑制PKs13TE结构域。图片来源:Cell

有了共晶结果,做化合物的结构修饰自然是事半功倍了,具体怎么增减基团似乎容易很多。值得一提的是,作者在优化结构的时候始终







































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