生物学正变得越来越量化。对细胞和分子生物学中的关键数字进行评估,通过侧面计算,可以让我们对细胞过程有更加深刻的了解。此外,这种计算为新实验技术数据流的定量分析提供了必要因素。然而,这样有用的数字却散布在浩瀚的生物学文献中,研究者们往往不得不像挖矿(BT币)慢慢挖掘,这种体验令人沮丧。
在这里,小编为您收集了一组生物学中的基本数字,这对于细胞中的分子过程产生一个数量级的感觉非常有帮助:
细胞大小(CellSize):
A.大肠杆菌(Coli,Bacteria):
直径:7-1.4um长度:2-4um体积:5-5um3密度与数量:-cell/ml时,OD≈1B.酵母(cerevisiae,Yeast):
直径:3-6um体积:20-um3C.哺乳动物细胞大小:
体积:-00um3*Hela细胞:-0um3(载玻片上贴壁时,直径:15-30um)
细胞内大小(LengthScalesInsideCells):
A.细胞核体积:≈10%的细胞体积
B.细胞膜厚度:4-10nm
C.平均的蛋白质直径:3-6nm
D.碱基对:2nm(D)x0.34nm(H)
E.水分子直径:≈0.3nm
细胞周期(CellCycleTime)
A.细胞周期时间(指数生长期):
大肠杆菌Coli:20-40min出芽酵母:70-minHeLa细胞:15-30hrB.DNA聚合酶复制:
大肠杆菌:-0bases/s人:40bases/s(RNA聚合酶转录:10-bases/s)C.核糖体翻译:10-20aa/s
D.降解速率(增殖状态的细胞):
mRNA半衰期细胞周期时间蛋白质半衰期≥细胞周期时间扩散系数(DiffusionRate)
A.蛋白质的平均扩散系数:在细胞质中=5-15um2/s
大肠杆菌:10ms横穿细胞HeLa细胞:10s横穿细胞*小分子代谢物质在水中=um2/s
基因组大小与错误率(GenomeSizesErrorRates)
A.基因组大小:
大肠杆菌Coli:≈5Mbp酿酒酵母cerevisiae:≈12Mbp线虫elegans:≈Mbp拟南芥thaliana:≈Mbp小鼠:≈2.5Gbp人:≈2.9Gbp小麦aestivum:≈16GbpB.蛋白质编码基因:
大肠杆菌:≈酿酒酵母:≈0线虫、拟南芥、小鼠、人:≈00C.DNA复制错配概率:10-8-10-10/bp
D.错误插入概率:
转录:10-4-10-5/核苷酸翻译:10-3-10-4/氨基酸
文章来源:每日生物评论
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