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带你解读影响因子299的SCI文章套路

发布时间:2018-2-5 13:46:25   点击数:
本次解读发表在NatureMedicine(IF=29.分)上一篇lncRNA文献。首先介绍下文献整体思路:lncRNA作为miRNAs的前体分子产生miR-和miR-b,然后miRNA通过参与激活Wnt信号通路介导结肠癌细胞对西妥昔单抗的耐药机制。同时作者寻找到lncrna上游调控lncRNAMIRHG的转录因子GATA6。下面就来详细了解一下文章内容吧。

首先作者通过3D培养获得结肠癌西妥昔单抗耐药细胞系,并加以验证:在对照组细胞中加入西妥昔单抗药物,24h通过检测增殖markerki67以及凋亡markerCaspase-3,发现对照组细胞增殖能力降低,凋亡增加,而耐药细胞系无明显变化,证明细胞获得耐药性。

作者通过全基因组测序以及RNA-Seq,在耐药组与对照组间筛选到个转录本上调,个转录表达下调,在这些转录本中上调最明显的是lncRNAMIRHG,同时还发现了上调最明显miR-b以及miR-。研究发现,lncRNAMIRHG与miR-b以及miR-表达密切相关,可能为两种MIRNA的前体。

为了探究lncRNAMIRHG以及所表达的miR-b与miR-在结肠癌西妥昔单抗耐药过程中发挥的作用,作者在耐药细胞中进行了miR-b与miR-的敲减,发现耐药组细胞克隆减少,裸鼠成瘤体积减小。而在对照组细胞中过表达miR-b与miR-,发现细胞克隆增多,裸鼠成瘤体积增大。

为了探究miR-b与miR-参与的西妥昔单抗的耐药机制,作者寻找在耐药组与对照组中表达下调的基因,筛选到wnt信号的负向调控因子DKK1以及DKK3,在耐药组中表达下调超过30倍,提示miR-b与miR-可能作用于wnt信号通路。

作者首先进行了双荧光素酶报告实验,证明miR-b、miR-与DKK1以及DKK3存在靶向关系,可能参与抑制DKK1以及DKK3的表达。同时,检测其他wnt通路负向调控因子ZNRF3、RNF43、APC2蛋白水平也发生了降低。

进而作者在耐药细胞中检测发现WNT信号通路激活。在耐药组肿瘤模型鼠中,b-catenin由胞质转移至胞核。

以上实验证明,miR-b与miR-抑制了wnt信号通路负向调控因子的表达,进而激活了wnt信号通路。

那么,在西妥昔单抗耐药发生过程中,是什么机制引起的miR-b与miR-表达上调呢?前面我们提到miR-b与miR-由MIRHG基因转录而来,作者推测可能存在调控MIRHG的转录因子,进而影响miR-b与miR-的表达。

通过RNA-Seq数据分析,作者







































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