转染试剂
瞬时转染和稳定转染可以选择不同的转染试剂，转染试剂的选择又可以根据已经发表的文献，已经有很多细胞株被成功转染，通过文献资料可以参考最适的转染试剂，当然也要根据不同的实验需求选择。一般来说转染试剂的要求是低毒，高效，廉价易得。
转染方法现在有多种方式能够实现细胞转染，如磷酸钙法，电穿孔法，脂质体转染法、逆转录病毒法等等。不同的转染方式其转染效率也不尽相同需要根据细胞的性质及不同的操作手法，摸索最佳的转染条件。
细胞状态
一般传代数小于50代以下的细胞即能保证基因型不变。瞬时转染最合适的细胞是达到对数生长期的细胞，此时细胞生长旺盛，最容易被转染。同一种系的细胞株，在不同实验室不同培养条件下，其生物学性状都会产生不同改变，从而导致其转染特性也发生变化。因此，针对这种转染效率降低的情况，应转用新鲜培养的细胞转染达到好的结果。
载体构建基因产物对细胞不能有毒害作用，瞬时转染难以进行。转染载体的构建选择可调控，强度合适的启动子很重要，可以做空载体或相同载体的其他基因为对照排除毒性对细胞的影响。病毒载体对特定宿主细胞感染效率较高，但不同病毒载体有其特定的宿主，有的还要求特定的细胞周期，如逆转录病毒需侵染分裂期的宿主细胞。细胞培养基培养基是瞬时转染的最基本要素。不同细胞选择不同的培养基，血清和其他添加物。使用的转染试剂要参考其说明书。培养物一定要避免细菌，支原体真菌的污染。
血清
血清是一种包含生长因子及其它辅助因子的成分不明确添加物，对不同细胞的生长作用有很大的差别。血清质量的变化直接影响细胞生长，因此也会影响细胞转染效率，不同批次购买的血清质量也会存在差别。对于传统的转染方法要求在无血清培养基条件下转染，血清被认为会降低瞬时转染的效率。针对现有人们常用的的转染试剂来说，血清的存在已不会影响转染效率，甚至还有助于提高转染效率。在转染过程中完全可以使用血清，RNA转染，消除血清中潜在的核糖核酸酶污染要格外