引言案例:一次由于抗体导致的惨重教训
在多伦多,LoanisPrassas博士和他的研究团队已经整整忙碌了两年,动用了超过五十万美元的研究经费。这一切辛劳都是为了验证他们的重大发现:新型的胰腺癌生物标志物CUZD1。然而,令LoanisPrassas博士头疼的是,他们的尝试一次次的失败,所有的努力似乎就要付诸东流。就在大家一筹莫展之时,一次偶然的机会,LoanisPrassas博士惊讶的发现,一切失败的根源,竟然是小小的一支CUZD1抗体!这支包含在CUZD1ELISA试剂盒中的抗体,最终被验证无法结合CUZD1蛋白,而是与另一种完全不同的抗原CA结合。这种荒谬的特异性直接导致了ELISA实验结果的巨大偏差,从而造成了该研究项目的接连失败。两年的汗水,巨额的经费,却换来了一个令人哭笑不得的结局。在年,愤怒的LoanisPrassas博士将这个ELISA试剂盒的验证报告发表在了Biotechnique上,并将矛头直指产品的供应商USCNLifeSciences。当这篇文章发表后,IoanisPrassas博士又有了让自己吃惊的发现:其实早在,另一个研究小组就遭遇了相似的困境。他们从USCNLifeSciences公司购买的ELISA抗体存在严重的特异性问题,并因此蒙受了巨大损失。他们曾发表论文警告科研人员,要谨慎的选择USCNLifeSciences公司销售的ELISA试剂盒!
LoanisPrassas博士为此懊恼不已:如果当初能吸取前车之鉴,在抗体选择上谨慎一些,这场灾难就不会发生了!
LoanisPrassas博士陷入的窘境,暴露出了抗体产业最汹涌的暗流:质量的稳定性和可靠性问题。
抗体质量问题普遍存在
其实对于科研人员来说,他们最需要的就是得到理想的实验结果,并且这个结果要足够稳定,可以长期被重复和再现。采购的抗体产品不work是令人头疼的问题,而使用这些抗体重复相同的实验,却得到前后矛盾的结果,则是更是灾难性的。这就牵扯到了抗体产品的两个可靠性问题:首先,在完成实验之前,你难以确定购买的抗体产品是否真的有效,能否带来理想结果。其次,在完成实验之后,你也很难判断利用抗体得到的结果是否稳定,能否被再次重复。
你可能会认为,科研总是充满不确定性,没人能保证自己的实验结果是%理想的。由于各种客观和主观的因素,科研试剂在使用中或多或少会产生一些偏差,这总是能被人理解的。如同其它科研试剂,抗体产品存在这种问题,不是很正常吗?
但是,抗体产品最不正常的地方在于,它们给实验带来的误差超出了人们的理解范围,巨大到足以阻碍整个生物学领域的研究进展。我们可以从一份令人震惊的研究报告中一窥究竟。HumanProteinAtlas(HPA)计划是瑞典发起的科研项目,旨在描绘全部人类蛋白质的特征。由于该项目要使用大量的抗体,为了保证实验结果的准确性,研究人员们首先对来自29家供应商的多种抗体(包括单抗和多抗)进行了WB和IHC的验证,来检测这些抗体是否能有效工作。检测结果令人大跌眼镜:49%的抗体完全无效(实验结果与生物信息学数据不符,或与实验数据不符),29%的抗体具有不确定性(与数据部分相符,或结果前后不一致),只有22%的抗体被认为是对实验数据是有支持性的。而更让人吃惊的是,仅有7%的抗体被认为是完全有效且拥有前后实验一致性。HPA计划的负责人之一EmmaLundberg无奈地表示:“仔细想想这件事,简直就像是买彩票!尽管这十分糟糕,但这就是现实。必须有人站出来处理这个问题。”
作为生物学研究领域应用最广泛的工具,抗体产品的地位毋庸置疑。而抗体质量的稳定性和可靠性是问题长久以来困扰着抗体产业,也是整个生物学研究领域的极大危机。抗体产品糟糕的质量会直接导致实验结果的误差,以及研究结果无法被重复和再现。研究项目的进展往往会因为抗体带来的问题停滞不前,由此造成的损失也是惊人的。据年的数据统计,仅在美国,平均每年就有3.5亿美元被浪费在这些无效抗体上。而在世界范围内,每年竟有8亿美元被浪费,占到了全球科研抗体总开销的50%。这份数据与上文提到的HPA抗体检测结果出奇地吻合:你有相同的几率买到有效的抗体和无效的抗体。对于抗体产品这种如同猜谜一般的随机性,许多科学家们已经忍无可忍。在年,AndrewBradbury,AndreasPlückthun和其他位生物科学家联名在Nature上发表了一份声明,呼吁业界将科研抗体的生产进行标准化,最大程度的提高抗体的可靠性,并减少由抗体造成的经费损失。
2.为什么抗体质量如此不稳定?
前文提到,抗体质量问题主要分为两个方面,我们就从这两个角度出发来探寻原因。
从第一个方面来看,科研人员们难以选择有效的抗体来进行实验,主要受到以下三个因素影响:
1).抗体特异性问题。从本质上来说,抗体的工作原理就是与特定蛋白或其他抗原结合,从而实现定性,定量,定位等检测。所以,抗体能否精确的结合抗原,是成败的关键,抗体的特异性(specificity)就显得尤其重要了。而对特异性影响最大的,莫过于抗体的交叉反应性(cross-reactivity)。如图1所示,在特异性正常情况下,抗体只能结合唯一的一种蛋白。而如果抗体本身出现问题(如结构等),可能会结合其它非目标蛋白,从而导致特异性降低。更令人恼火的是,如果抗体的特异性问题很难被检测出来。假设某个糟糕的抗体X理论上只结合蛋白A,但是它也可以结合蛋白B。当实验样本里蛋白B没有出现时,它将完全得到完全正确的实验结果。如果当样本中包含蛋白B,偏差就出现了。试想一下,你在应用抗体X时,如果你在项目前期没有使用过蛋白B样本,一切都会很顺利。但是在项目后期,你开始加入蛋白B样本,你的实验结果就完全乱了套。那么问题就来了:你事先并不知道抗体X可以结合非目标蛋白B,所以你完全无法解释为什么项目的前后会出现偏差。
图1:抗体的交叉反应性示意。
抗体出现交叉反应,导致特异性降低,主要是由抗体本身的质量问题引起的。由于抗体本身结构和生产过程的复杂性,生产商稍有疏忽,抗体质量就会出现问题。由于抗体是科研的刚需产品,利润又很高,所以引得众多公司疯狂进入到这个市场,直接导致了市面抗体产品质量良莠不齐,供应商鱼龙混杂。而市场本身又缺少有力的监督和管理机制,抗体频频出现质量问题也就不足为奇了。可能你会认为,小公司的抗体质量容易出现问题,那么像Abcam,SantaCruz这种行业领袖的产品质量总该让人放心了吧?但下面这些研究会告诉你:这场危机无人能幸免。
年,美国多所大学的研究人员联合对种应用于遗传学研究的histone抗体进行了检测和评估,这些产品大部分来自Abcam,Novus,MerckMillipore等知名公司。。使用WB和Dot-Plot进行的抗体特异性检测结果表明,25%的抗体产品会结合一种以上的蛋白,特异性存在问题。而在剩余75%特异性合格的产品中,20%在IHC实验中无效。详细的检测报告和产品资料已经被发布在研究小组的数据库中:北京白癜风医院治疗方法北京白癜风十佳医院