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细胞周期分析,我如何确定几倍体

发布时间:2020-11-2 19:25:12   点击数:
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一个细胞周期结果出来,如果已经知道样本是2倍体,很简单,用Modfit等专业软件,一拟合,马上就出来了:

但如果样本的倍体未知呢?苦恼了。没关系,两个绝招。

1、用鸡红细胞核

我们会发现,很多标准的Protocol里面,都会提到用鸡红细胞做倍体参照,其实就是鸡红细胞核(CEN)。CEN的DNA含量大约是人的35%,这就意味着人的细胞DNA指数是1.0,CEN的DNA指数是0.35。因此,可以用CEN峰的位置,就能确定未知样品的相对DNA指数,见下图,CRBC就是CEN。

另外,也可以用鳟鱼红细胞核(TEN),但TEN的DNA含量是人的80%,就是DNA指数0.8,所以TEN的G2/M峰可能会与人细胞的S期重叠,使得细胞周期分析困难。因此,大多数情况下,还是会用CEN,不会对样本的直接分析产生干扰。

2、用已知倍体的样本

如果你有已知的倍体,也是可以用于做参照的。例如有一份已知二倍体的细胞,上机后得到2C和4C两个峰,再上一个未知样本,发现其两个峰分别是4C和8C的位置,那么就可以确定该样本是四倍体。但分析的时候,不能像用CEN那样直接采用混合样本,因为已知倍体的样本会对分析产生干扰。所以个人建议需要设置两管:(1)已知倍体+未知倍体,确定倍体类型(2)未知倍体,分析倍体和周期分布

参考:Vindel?v,L.L.,Christensen,I.J.,Nissen,N.I.()Standardisationofhigh-resolutionflowcytometricDNAanalysisbythesimultaneoususeofchickenandroutredbloodcellsasinternalreferencestandards.Cytometry3,-.

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